由血栓引起的稱為血栓栓塞（thromboembolism）最為常見，占一切栓塞的99％

血栓栓子約90％以上來自下肢深部，特別是腘靜脈、股靜脈和髂靜脈偶可來自靜脈,很少來自下肢淺表靜脈。較小的栓子栓塞肺支多見于肺下葉，因肺動脈和動脈之間有豐富的支支氣管動脈的血流可以通過吻合支供應該區肺，后者可賴以避免；但若栓塞前肺已有嚴重，栓塞的局部肺組織盡管有支氣管動脈的供血其仍不能維持該部肺組織的正常生存，局部遂出現性梗死嘚影響取決于栓子的和數量，栓子體積即使不大但數量多，廣泛地栓塞肺動脈分支；或栓子大栓塞動脈主干或支，即、、甚至急性呼吸衰竭而。巨大的血栓栓子主要來源于下肢靜脈有時來自右心附壁血栓。特別長的栓子可形成騎跨性栓塞阻塞左右肺動脈干

肺動脈栓塞引起猝死的機制尚不十分明了。一般認為肺動脈主干或大分支栓塞時一般認為肺動脈主干或大分支栓塞時，肺動脈性收縮和血栓栓孓內釋出的5－羥色胺血惡烷A2引起的支氣管和導管痙攣和肺動脈、心冠狀動脈、支氣管動脈痙攣是的原因。

栓子絕大數來自左心的血栓（洳亞急性性心內膜炎時贅生物、時左心房附壁血栓、的附壁血栓）其次為和內膜表面的血栓。當有右向左分流的先先性心隔膜缺損時患者的可以從右心通過該缺損進入左心，造成大循環的動脈的栓塞稱為反常栓塞（paradoxical embolism）。動脈栓塞以下肢、腦、腎、脾為常見當栓塞的動脈缺乏有效的側支循環時，則不可避免地引起局部組織的梗死例如腦底Wills環栓塞，其環狀的動脈聯系可保證該部任何阻塞皆不導致腦的梗死但Wills環遠端栓塞時，則必然發生肝有肝動脈和門靜脈雙重供應，所以肝動脈分支栓塞很少引起梗死

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