人类染色体5p15.33（TERT-CLPTM1L）、8p11（CHRNB3-CHRNA6）区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性的fine mapping研究--《复旦大学》2011年硕士论文
人类染色体5p15.33（TERT-CLPTM1L）、8p11（CHRNB3-CHRNA6）区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性的fine mapping研究
【摘要】：肺癌是全球发病率和死亡率最高的癌症之一,其5年存活率不足15%,严重威胁人类健康及生命。吸烟是导致肺癌的最主要环境因素,80-90%的肺癌发生与吸烟有关,但只有10-15%的吸烟者会得肺癌,提示遗传多态性在肺癌发生过程中发挥重要作用。
人染色体5p15.33(TERT-CLPTM1L)区域的两个基因hTERT和CLPTM1L分别与细胞增殖、衰老及肿瘤分化、浸润、转移能力和细胞凋亡等重要的生物学功能密切相关,目前国际上关于该区域与肺癌易感性的GWAS报道有很多。为在中国汉族人群中探讨人染色体5p15.33 (TERT-CLPTM1L)区域基因多态性与肺癌易感性的关系,本文采用病例-对照研究方法,在第一阶段784例肺癌患者和782例性别、年龄、籍贯频数与之相匹配的健康对照中对该区域14个标签SNP位点进行基因分型,统计分析其等位基因频率及基因型频率与肺癌易感性的关系。结果发现rs2736100(CA)位点C等位基因可增加罹患肺癌的风险,在显性模型下(CA+CC)与AA相比肺癌风险上升了55%(校正OR=1.55,95%CI=1.23-1.96；P=0.0002)。rs2736098(CT)位点的TT纯合子可使肺癌风险显著上升(校正OR=1.53,95%CI=1.09-2.51；P=0.013)。rs4246742(TA)位点的AA纯合子也显著增加肺癌风险(校正OR=1.48,95%CI=1.06-2.07；P=0.020)。分层分析显示这3个位点都是与腺癌风险相关。对这3个位点的联合效应与肺癌的相关性研究发现,3个位点全部为罕见等位型的个体与全部为常见等位型的个体相比,罹患肺癌的风险增加了60%(校正OR=1.60,95%CI-1.28-1.99；P=3.0×10-5),而罹患腺癌的风险上升了88%(校正OR=1.88,95%CI-1.44-2.45；P=2.98×10-6)。经rs2736098和rs4246742校正之后,rs2736100位点在肺癌患者和健康对照间的基因型分布仍存在显著性差异(校正OR=1.24,95%CI=1.05-1.48；P=0.014)。我们在第二阶段975例肺癌患者和1022例与之相匹配的健康对照样本中进一步验证了rs2736100的C等位基因可增加肺癌罹患风险。在显性模型下,(CA+CC)基因型与AA基因型相比,肺癌发病风险上升34%(校正OR=1.34,95%CI=1.09-1.65；P=0.005)。将两期样本合并进行分析发现,(CA+CC)基因型携带者罹患肺癌的风险是AA携带者的1.43倍(校正OR=1.43,95%CI=1.23-1.67；P=5.0×10-6),对合并的样本进行分层分析,结果显示,CA基因型携带者罹患腺癌的风险是AA基因型的1.44倍(校正OR=1.44,95%CI=1.18-1.76；P=3.51×104),而CC基因型携带者罹患腺癌的风险则是AA基因型的1.95倍(校正OR=1.95,95%CI=1.53-2.48；P=6.52x 10-8)。
本研究揭示人染色体5p15.33(TERT-CLPTM1L)区域基因多态性与中国汉族人群腺癌易感性相关。
人染色体8p11 (CHRNB3-CHRNA6)区域的两个基因CHRNB3和CHRNA6分别编码神经型尼古丁乙酰胆碱受体的β3亚基α6亚基,目前国际上有许多GWAS报道该区域基因多态性与个体吸烟行为和肺癌易感性相关。为在中国汉族人群中探讨人染色体8p11 (CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与肺癌易感性的关系,本文采用病例-对照研究方法,在784例肺癌患者和782例性别、年龄、籍贯频数与之相匹配的健康对照中对该区域6个标签SNP位点进行基因分型,统计分析其等位基因频率及基因型频率与肺癌易感性的关系,并探讨吸烟在其中的影响。结果发现rs(TC)位点TT基因型在60岁以上人群(校正OR=0.42,95%CI=0.20-0.88; P=0.022)、女性人群(校正OR=0.34,95%CI=0.13-0.87;P=0.025)、非吸烟人群中(校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.79；P=0.013)对肺癌发生具有保护效应；rs4236926(TG)位点TT基因型在60岁以上人群(校正OR=0.48,95%CI=0.23-0.99; P=0.048)、非吸烟人群中(校正OR=0.32,95%CI=0.13-0.80；P=0.014)对肺癌发生具有保护效应。这种保护效应主要是与腺癌相关。对这两个位点进行累积效应分析发现含有3-4个变异等位基因型的非吸烟者罹患肺癌的风险显著降低(校正OR=0.29.95%CI=0.11-0.71; P=0.007)此外含有3-4个变异等位基因的个体累计吸烟量(mean pack-year= 13.2)与其他个体相比显著降低。
本研究揭示人染色体8p11 (CHRNB3-CHRNA6)区域基因多态性与中国汉族人群肺癌易感性和吸烟行为相关。
【学位授予单位】：复旦大学【学位级别】：硕士【学位授予年份】：2011【分类号】：R734.2
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400-819-9993染色体异常致反复和后代5p12-15.3三体:一对叙利亚夫妇报道及文献复习（英文）--《中华男科学杂志》2015年03期
染色体异常致反复和后代5p12-15.3三体:一对叙利亚夫妇报道及文献复习（英文）
【摘要】：在本研究中,我们介绍一叙利亚夫妻发生孕早期反复流产、胎儿畸形和/或新生儿死亡。经检查,父亲表型正常,有一个平衡的染色体易位t(5;15),在无精子症因子(AZF)b座位s Y125基因发生了微缺失而且其伴有MTHFRC677T纯合子基因多态性。值得注意的是,他的妻子则伴有MTHFRA1298C纯合子基因多态性。这对夫妻经历了两次流产,有2个夭折的孩子均为严重畸形,为5号染色体短臂部分三体。夫妻结婚10年后没有任何存活后代。
【作者单位】：
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【分类号】：R596.1
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400-819-9993出芽酵母の染色体DNA複製におけるOrc5pのATP結合活性の役割に関する研究
By&Naoko Takahashi
Year: 2004
OAI identifier:
oai:EPrintsOUDIR.lib.okayama-u.ac.jp:8805
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一例父源染色体有两种新生5p缺失的患者
【摘要】：一例父源染色体有两种新生５ｐ缺失的患者但美霞ＮｉｅｂｕｈｒＡ张小晓高春生刘国仰杨焕明ＮｉｅｂｕｈｒＥ罗会元猫叫综合征是５号染色体短臂缺失引起的综合征之一［１，２］。典型患者的主要临床症状有“似猫叫哭声”，典型的面部或其他特征，以及不同程度的智力低下和...
【作者单位】：
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