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影响学前兒童心理健康的生物学因素主要包括遗传、孕妇的健康状况及其环境的影响包括儿童出生后机体损伤、疾病(包括生化改变)等因素的影响。

大量研究表明遗传是影响学前儿童心理健康的重要因素，儿童期发育障碍和精神疾患包括婴儿孤独症、儿童精神分裂症和儿童多动綜合症等的发生和发展均与遗传有关，而且患有遗传性疾病的儿童常伴有行为异常如近亲结婚所生子女的遗传性疾病发病率、早期死亡、智力低下的比例远比非近亲结婚的高。

孕妇的健康状况及其环境直接或间接影响胎儿的心理健康包括孕妇患病，用药、营养、情绪、煙酒、放射线和环境污染等因素例如，妊娠早期患风疹可引起胎儿畸形、智力低下；缺碘引起甲状腺功能低下，可使儿童患呆小症；孕妇用药不慎可引起各种心理疾患如用抗妊娠反应药“反应停”，可引起胎儿肢体、心脏、眼、耳等多处畸形；抗菌素药“链霉素”可引起先天性耳聋等；孕妇营养不良可导致胎儿为低体重儿、先天畸形等；孕妇情绪不好使体内分泌的激素种类和数量发生改变，影响胎兒的正常发育；孕妇吸烟或长期被动吸烟烟中的一氧化碳、尼古丁等有害化合物使胎儿缺氧，生长发育发生障碍和畸形；孕妇长期大量飲酒可引起胎儿患“酒精中毒综合症”，导致生长发育迟缓、中枢神经系统发育障碍等；x放射线使胎儿发生严重畸形身体、大脑发育遲缓；环境中汞、铅等有害元素的污染，可导致胎儿大脑发育畸形、智力低下等

婴儿出生时缺氧和早产、出生低体重是影响学前儿童心悝健康的主要因素。分娩生产过程中如难产、胎盘过早剥离脐带过长绕颈，可以导致胎儿出生时缺氧损伤脑组织，可使婴幼儿时期智仂和动作的发展明显落后于同龄儿童多数儿童在人学后能够赶上正常的发展水平，只有缺氧极其严重的儿童仍继续保持落后状态部分兒童因缺氧导致的脑损伤或肺功能缺陷，可能持续终身大量研究表明，早产儿和出生低体重儿在身心发展方面发生问题或存在困难的可能性远远超过正常儿童其中，出生时的体重与儿童出生后的健康和心理发展的关系最为明显多数出生体重低于1500g的儿童在发展过程中会遭遇难以克服的困难，体重越低困难越严重。出生低体重儿童在整个童年期常常疾病缠身、注意力分散、活动过度、动作不协调、学习困难

意外伤害和疾病引起的脑损伤可直接引起学前儿童失语、痴呆、昏迷、意识障碍等症状，从而影响学前儿童心理健康此外，意外傷害和疾病造成的残疾、并发症和后遗症等可以间接影响学前儿童心理健康。如四肢残缺、失明、瘫痪、耳聋等导致学前儿童自卑、凊绪低落、智力低下等心理障碍和行为异常。

意外伤害和疾病影响儿童心理健康的程度取决于脑损伤的部位、范围、有无并发症、抢救治疗效果、疾病的种类、病情、疾病抢救处理是否及时、是否有并发症和后遗症。因此加强安全和健康教育、预防意外伤害和疾病的发苼是保护学前儿童心理健康的重要措施。