口腔黏膜溃疡的病程分为以下五個阶段：
第一、开始出现刺痒通常发生在溃疡的1-2天。
第二、溃疡初发阶段是开始出现的阶段逐渐出现疼痛不舒服的症状。
第三、溃疡擴大、加重是在溃疡出现的第3-6天，这个时候症状相对严重周围组织也有一定的反应。
第四、病毒逐渐得到消灭溃疡开始好转或缩小。
第五、最后一个阶段是溃疡完全愈合一般需要8-12天。
口腔黏膜溃疡大多数是有自限性的只要身体抵抗力好、加强口腔卫生会逐渐愈合。如果局部的肿痛不是很严重多漱口、多刷牙、保持口腔卫生、提高身体抵抗力、好好休息一般很快就能愈合。如果肿痛很严重影响患者的生活，尤其是出现发烧或者是进食比较差的情况可以到医院的口腔科进行就诊。